به گزارش صبح رزن،محمد جوان اخوان مدیر اندیشکده برهان در کانال تلگرامی خود نوشت:

برای آنکه با چهره ای این منتقد خشونت بیشتر آشنا شویم کافی است چند سطر زیر را مطالعه کنید:

 در سالهای پیش از پیروزی انقلاب اسلامی، یعنی هنگامی که امام خمینی به طور صریح روی فعاليت هاي غيرمسلحانه و انقلاب مبتني بر آگاهي توده تاکید داشتند، آقای هادی غفاری مردم را به «مصادره سلاح» از پاسبان ها دعوت می کرد ؛ یا به عنوان مثال، در راهپیمایی ها با تقلید از شعارهای مجاهدین خلق، شعار «تنها ره رهايي، جنگ مسلحانه» را برگزیده بود. هنگامی که به ایشان تذکر داده می شد که این شعارها مورد پذيرش امام نيست، با این انتقادات به تندی برخورد می کرد.

 پس از انقلاب، هادی غفاری به عنوان نماینده مردم وارد مجلس شورای اسلامی شد. یکی از موارد برخورد خشونت آمیز ایشان در مجلس، ماجرای حمله به صباغیان و معین فر (از نیروهای ملی مذهبی) است. معین فر داستان این حمله را این طور بازگو می کند: «حضار جلسه ملاحظه کردند که حدود ۱۰ نفر از نمایندگان محترم بر سر آقای صباغیان ریختند و با ضربات مشت و لگد ما را مضروب و مصدوم کردند. خصوصاً حضرت حجت الاسلام و المسلمین جناب آقای هادی غفاری با خارج ساختن کفش از پای خود و کوفتن های مرتب بر سر و صورت و بدن اینجانب گوی سبقت را از دیگران ربودند. ایشان همچنین فحش های عرضی و ناموسی زن، مادر و خواهر نثار من کردند که مستوجب حد است».

عزت شاهی از مبارزان قبل از انقلاب که پس از انقلاب مدتی مدیر زندان قصر بوده است نیز از رفتار خشن و تند غفاری با زندانیان و متهمان سخن گفته است.

 در سال ۸۸ نیز برخی رسانه ها از کشف سلاح جاسازی شده در مسجد تحت مدیریت او خبر دادند.